2018-11

データサイエンス

特殊な行列をまとめる(逆行列・正則行列など)

fMRI Data Analysis

SPM12の使い方メモ

SPM12の使い方 SPM12の解析手順の記録しようと思います。(私が忘れてしまうので...) SPMは、MATLAB上で動作するので、当たり前ですが、MATLABが必須となります。 fMRIの実験において、実験デザインは...
fMRI Data Analysis

SPM12|Specify 1st-level(モデル決定)

SPM12|Specify 1st-level(モデル決定) SPM.matが作成される 設定 ブロックデザインについての設定です。 事象関連デザインの場合は、Slice Timingを実行するので、でSecondsを選択す...
fMRI Data Analysis

SPM12|Smooth(平滑化)

SPM12|Smooth(平滑化) SPM12のSmooth(平滑化)の手順をメモします。 Smoothで作成されるファイルは、 s+ファイル名 の1種類のみです。 Normalizationで作った、...
fMRI Data Analysis

SPM12|Normalise(標準化)

SPM12|Normalise(標準化) SPM12のNormalise(標準化)の手順をメモしていきます。 出力されるファイルは、 w+ファイル名 y_mean+ファイル名 の2種類のファイルが作成される。 ...
fMRI Data Analysis

SPM12|Realign(動き補正)

SPM12|Realign(動き補正) SPM12のRealign(動き補正)の手順を記録します。 出力されるファイルは、 r+ファイル名 rp_f-MRI_001.txt mean+ファイル名 上の3種類のファ...
fMRI Data Analysis

BOLD効果とfMRIのメモ

BOLD効果とfMRIのメモ fMRIの原理である、BOLD効果についてのメモです。 BOLD効果を誰でも分かるように、簡単に説明していきます。 BOLD効果とは BOLDは、 Blood-Oxygenation-...
画像処理とOpenCV

Python+OpenCV|AKAZE特徴量

AKAZE記述子 FED(fast explicit diffusion)と呼ばれる数学的手法を用いて大幅な高速化を図っている。 さらに、M-LDB(robust modified-local difference binary)と...
画像処理とOpenCV

Python+OpenCV|KAZE特徴量

KAZE記述子 SIFTやSURFでは、DoG画像をベースに特徴点を検出している。 KAZEでは、AOS(additive operator splitting)と可変コンダクタンス拡散(variable conductance d...
回帰分析

回帰分析のt値の求め方:Pythonで実装

t検定とt値とは t値は、モデルの説明変数のそれぞれについて、計算されます。 このt値が「2」以上なら、その説明変数は、「統計学的に、モデルに組み込むのは良い」または、「統計学的に支持される」ことを意味する。 逆に、t値が「1」未満な...
ディープラーニング

PyTorchのインストールとニューラルネットワーク

画像処理とOpenCV

LoGフィルタ

LoGフィルタ LoG(Laplacian of Gaussian) ガウシアンフィルタを掛けた後に、ラプラシアンフィルタを掛ける操作 $$LoG(x,y) = \frac{x^2+y^2-\sigma^2}{2\pi\s...
画像処理とOpenCV

DoGフィルタのメモ

DoGフィルタ DoG(Difference of Gaussian) σの値が異なる2つのガウシアンフィルタの画像の差分とる。 この差分が作るフィルタをDoGフィルタと呼ぶ。 DoGフィルタは、LoGフィルタと処理...
画像処理とOpenCV

モラベックコーナ検出のメモ

モラベックコーナ検出 画像の小領域を設定する。 コーナが含まれているならば、この小領域をどの方向に動かしても、小領域内の画像は大きく変化する。 平坦ならば、変化しない。 エッジならば、一方向について変化する。 これ...
画像処理とOpenCV

へシアンコーナ検出

へシアンコーナ検出 画像をx方向、y方向、輝度Iの3次元空間における曲面とみなす。 コーナは曲面が大きく変化している点と考えることができる。 コーナ検出するには、xyI空間で曲率が大きな点を探せばよい。 曲率には、ガウス曲率...
画像処理とOpenCV

Python+OpenCV|HoG特徴量

HoG特徴量 大まかなアルゴリズム 入力画像の分割 入力画像を複数の"ブロック"に分割します。 各ブロックをさらに"セル"に分割します。 微分フィルター 入力画像を微分フィルターに掛けます。 勾配強度と勾配方向...
fMRI Data Analysis

実験デザインと血流動態(HRF)モデル

fMRI Data Analysis

血流動態反応関数(HRF)をPythonでモデリング

画像処理とOpenCV

Python+OpenCV|ハリスコーナ検出器

ハリスコーナ検出器 大まかな手順 画像の平滑化 各画素の微分を計算する 行列M(後述)を計算する コーナネスC(後述)を計算する コーナネスCの値が閾値より大きければ、コーナと判定する 行列Mは次のよう...
画像処理とOpenCV

Python+OpenCV|Prewittフィルター

Prewittフィルター Prewittフィルターは、次のフィルターで表される。 x方向 $$F_x = \begin{bmatrix} -1 & 0 & 1 \\ -1 & 0 & 1 \\ -1 & 0 & 1 \end{...
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