fMRI

SPM12|WFU_PickAtlasでROI解析 SPM12でWFU_PickAtlasというツールを使って、ROI解析をします。 対象の部位だけにマスクをかけて、その部分だけの解析結果を表示させます。 WFU_PickAtla...

SPM12でSPM8のNormalisation(標準化)する方法 SPM12でSPM8の標準化をする方法を紹介します。 SPM12とSPM8では、デフォルトでMNIが違います。 SPM12では、標準化後のサイズが79-95-...

SPM12|Batchで一括で解析する方法 Batchの作り方 Batchの作り方を紹介します。 今回実行する手順は、このサイトで紹介したSPM12の手順をと同じです。 spm12|Realign（動き補正） sp...

SPM12|Check Reg Check Regでは、複数のMRI画像を並べて、確認することができます。 参考 spm12_startersguide.pdf

SPM12|Display Displayでは、fileのサイズ(x-y-z座標)などの、NIfTI画像とその情報を確認することが出来ます。 参考 spm12_startersguide.pdf

Results(結果表示) Estimateの結果を表示させます。 Estimateで作られた、SPM.matを選択します。 Define new contrastをクリックします。 define c...

SPM12|Estimate(推定) は、Specify 1st-levelで作られた、SPM.matを選択する。 参考 spm12_startersguide.pdf

SPM12の使い方 SPM12の解析手順の記録しようと思います。（私が忘れてしまうので...） SPMは、MATLAB上で動作するので、当たり前ですが、MATLABが必須となります。 fMRIの実験において、実験デザインは...

SPM12|Specify 1st-level（モデル決定） SPM.matが作成される 設定 ブロックデザインについての設定です。 事象関連デザインの場合は、Slice Timingを実行するので、でSecondsを選択す...

SPM12|Smooth（平滑化） SPM12のSmooth（平滑化）の手順をメモします。 Smoothで作成されるファイルは、 s+ファイル名 の１種類のみです。 Normalizationで作った、...

SPM12|Normalise（標準化） SPM12のNormalise（標準化）の手順をメモしていきます。 出力されるファイルは、 w+ファイル名 y_mean+ファイル名 の２種類のファイルが作成される。 ...

SPM12|Realign（動き補正） SPM12のRealign（動き補正）の手順を記録します。 出力されるファイルは、 r+ファイル名 rp_f-MRI_001.txt mean+ファイル名 上の３種類のファ...

SPM12でDICOMをNIfTIに変換する SPM12を起動します。 右下のをクリックし、変換したいDICOMを選択します。 変換するファイルは、NIfTIなので、下のSingle Fileを選択して...

MRIConvertの使用感 MRIConvertは、NIfTIに変換したいDICOMファイルの入ったフォルダを選択して、実行するだけで、自動的にフォルダー管理してくれます。 通常のMRIの撮像では、位置の撮像・T1強調画像・fMR...